应届生和公司签订的两方协议有没有法律效力？

没有法律效力。

劳动合同中如果没有培训条款和竞业禁止条款的约定，且用人单位支付过经济补偿，一律不需要支付违约金。单位约定的违约金条款无效，不需要支付。

1、三方协议仅限于应届毕业生在求职阶段与拟用人单位签订的合同，效力仅限于取得毕业证以前；

2、三方协议的目的是约束应届毕业生毕业后进入拟用人单位工作，同时要求拟用人单位在毕业生毕业后与该毕业生签订劳动合同，因此如果用人单位与应届毕业生签定了正式的劳动合同，则三方协议的效力自然解除；

3、正式劳动合同可以约定的违约条款仅局限于涉及保密条款和设定服务期的合同，其他任何情形都不得为劳动者设定违约金。三方协议的违约条款仅针对应届毕业生毕业后未进入用人单位，在正式劳动合同签订后，该违约条款所需的基础已经不复存在，所以违约条款当然不可能顺延至正式劳动合同中；

4、三方协议是计划经济与市场经济过渡期间的产物，对于三方协议没有准确的法律予以规定，但是正式工作以后，可以参见《劳动法》、《劳动合同法》等及相关劳动法律法规。