请问合同应该如何管理、编号、如果遇到某合同的补充协议应怎么编号？

编制合同档案的时候，是按公司名称、合同类型、流水号、签订日期的代码来编的.如果遇到某合同的补充协议，则不另编号，附在合同正本后面，和附件放在一起。 同补充协议签署在后，一般以补充协议所约定内容为准。

法律分析

合同编号是为了区别不同合同，而按照一定规则加上的一个字母和数字组成的编号。一般来说，每个企业都是按照本单位的编号规则进行合同编号的，以便于登记和查阅。补充协议中一般都会在尾部写明“原合同与本补充协议不一致的，以本补充协议为准”。双方协商一致，可以对合同进行变更。补充协议签署在后，与主合同不一致，应视为双方对主合同的变更，因此应以补充协议为准。 补充协议的性质

“补充协议”或者称为“协议补充”，是指当事人对于合同中的内容没有约定或者约定不明确的，而达成的协议。“补充协议”是相对于已经存在的合同而言的，“协议补充”就是通过协议方式补充已经存在的合同中存在的漏洞。因此，已经存在的合同与“补充协议”之间是主从关系。已经存在的合同是主合同，“补充协议”是从合同。 已经存在的合同作为主合同不以“补充协议”的存在为前提，或者说不受“补充协议”的制约而独立存在。反之，“补充协议”必须以已经存在的合同的存在为前提，自身不能独立存在。尽管“补充协议”相对于主合同而言没有独立性，但是其本身也是协议。

法律依据

《中华人民***和国民法典》 第五百一十条 合同生效后，当事人就质量、价款或者报酬、履行地点等内容没有约定或者约定不明确的，可以协议补充；不能达成补充协议的，按照合同相关条款或者交易习惯确定。