在北京“车牌租赁协议”，发生纠纷，法院会怎么

这个是有事实案列的，法律是讲究事实的，车是谁的就是谁的，车牌是谁的就是谁的，如果真的走司法这项程序，租赁协议是可以作为证据出现的。租赁协议虽然是不受法律保护，但却能证明车和车牌的真实所有人。