学生要保护自己的合法权益，应以哪两种法律为根本？

应当是《中华人民***和国未成年人保护法》和《中华人民***和国预防未成年人犯罪法》。

七届全国人大常委会于1991年9月审议通过的《未成年人保护法》，是我国第一部旨在全面保护未成年人合法权益，保障未成年人健康成长的专门法律。

1999年颁布的另一部关于未成年人的专门法律--《预防未成年人犯罪法》,是继《未成年人保护法》之后，我国又一部旨在保护青少年身心健康、促进青少年健康成长的重要法律。