中华人民共和国政府对香港、澳门行使主权分别是在

法律分析：我国分别于1997年、1999年对香港、澳门恢复主权行使。

法律依据：根据《香港特别行政区基本法》序言规定：香港自古以来就是中国的领土，一八四○年鸦片战争以后被英国占领。一九八四年十二月十九日，中英两国政府签署了关于香港问题的联合声明，确认中华人民***和国政府于一九九七年七月一日恢复对香港行使主权，从而实现了长期以来中国人民收回香港的***同愿望。根据《澳门特别行政区基本法》序言规定：澳门，包括澳门半岛、凼仔岛和路环岛，自古以来就是中国的领土，十六世纪中叶以后被葡萄牙逐步占领。一九八七年四月十三日，中葡两国政府签署了关于澳门问题的联合声明，确认中华人民***和国政府于一九九九年十二月二十日恢复对澳门行使主权，从而实现了长期以来中国人民收回澳门的***同愿望。