有证据证明事实不清的案件怎么判

如果是刑事案件，事实不清证据不足法院会作出证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决；如果是民事案件，事实不清证据不足法院会作出驳回原告诉讼请求的判决。

法律依据

《刑事诉讼法》第二百条

在被告人最后陈述后，审判长宣布休庭，合议庭进行评议，根据已经查明的事实、证据和有关的法律规定，分别作出以下判决：

（一）案件事实清楚，证据确实、充分，依据法律认定被告人有罪的，应当作出有罪判决；

（二）依据法律认定被告人无罪的，应当作出无罪判决；

（三）证据不足，不能认定被告人有罪的，应当作出证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决。