第一次鉴定对方不认可，对方提出由法院指定鉴定机构，但还未做鉴定但对鉴定所所长有质疑怎么办？

如果在鉴定过程中对方不认可第一次鉴定的结果，并提出由法院指定鉴定机构进行再次鉴定，但对鉴定所所长有质疑，建议您采取以下措施：

询问具体质疑：首先，您可以询问对方对鉴定所所长的质疑具体是什么，是否有相关证据或者事实依据。如果对方能够提供具体的质疑内容和证据，您可以考虑向法院提出相关反驳意见。

寻求法律援助：如果您认为对方的质疑没有实际依据，且可能会影响到鉴定结果的公正性和准确性，建议您寻求法律援助，向法院提出相关的申诉和反驳意见，维护自己的权益。

预约鉴定：法院指定的鉴定机构具有公正、专业的资格和能力，如果对方质疑鉴定所所长的资质，可以通过预约鉴定时向鉴定机构提出相关质疑，以保证鉴定结果的公正性和准确性。

总之，如果在鉴定过程中出现争议，建议您先与对方协商沟通，尽量达成***识；如无法协商解决，可以考虑向法院提起申诉，以维护自己的合法权益。